Nueva estrategia mejora la detección de mutaciones genéticas en el cáncer colorrectal hereditario

una mayor precisión y menor tiempo de respuesta de las pruebas pueden proporcionar información vital para los pacientes con sospecha de síndrome de Lynch y sus familiares, de acuerdo con un informe publicado en la revista Journal of Molecular Diagnostics

Elsevier Health Sciences

Philadelphia, PA 27 de agosto, el año 2015 - Alrededor del 3% de los cánceres colorrectales se debe al síndrome de Lynch, un síndrome de susceptibilidad al cáncer hereditario que predispone a los individuos a varios tipos de cáncer. Los parientes cercanos de sangre de pacientes con síndrome de Lynch tienen una probabilidad del 50% de la herencia. El papel que juegan PMS2 mutaciones genéticas en el síndrome de Lynch se ha subestimado, en parte, debido a las limitaciones tecnológicas. Un nuevo estudio publicado en Journal of Molecular Diagnosticsdescribes una estrategia multi-método para superar las limitaciones tecnológicas existentes mediante la identificación de mutaciones de genes con mayor precisión PMS2, lo que mejorará el diagnóstico y apoyar el asesoramiento genético apropiado y manejo médico.

La mayoría de los casos de síndrome de Lynch se atribuyen a mutaciones de línea germinal heterocigotos en los genes de reparación de ADN no coinciden MLH1 y MSH2, y los métodos actuales para la secuenciación de ADN y análisis de deleción puede detectar con éxito estas mutaciones. Sin embargo, al menos el 16% o más no pueden ser analizados con estos métodos, porque los individuos tienen una mutación en otro gen de reparación de genes, PMS2 (PMS 1 homólogo 2, reparación de genes componente del sistema).

Los investigadores informan sobre un nuevo método de análisis desarrollado para llenar el vacío de detectar con precisión las mutaciones PMS2. "Mutaciones PMS2 han sido subestimado debido a dificultades técnicas en el manejo de la estructura genómica compleja. Un enfoque integral para identificar de manera inequívoca las mutaciones PMS2 permanecido a desarrollarse ", explicó el investigador principal, Lee-Jun C. Wong, PhD, del Laboratorio de Genética y Baylor Miraca Departamento de Genética Molecular y Humana, Baylor College of Medicine (Houston, TX). Estos problemas incluyen la presencia de un gran número de secuencias altamente homólogas en otras regiones genómicas y el intercambio secuencia frecuente entre activo y pseudogenes, junto con la alta frecuencia de tinción negativa de PMS2 por inmunohistoquímica.

Los investigadores desarrollaron una estrategia de tres partes, la combinación de la captura dirigida secuenciación de próxima generación (NGS), la sonda de amplificación dependiente de ligado múltiplex y de largo alcance PCR seguida de NGS para detectar simultáneamente mutaciones puntuales y copiar los cambios de numeración del gen PMS2. "Los resultados de los tres métodos sirven para la validación cruzada como una mayor precisión y menor tiempo de vuelta", comentó el co-investigador Victor Wei Zhang, MD, PhD, del Departamento de Genética Molecular y Humana, Baylor College of Medicine.

El uso de este análisis, los investigadores identificaron deleciones en la región codificante del gen (en los exones E2 a E9, E5 a E9, E8, E10, E14, y E1 a E15), duplicaciones (E11 a E12) en dos cromosomas, y una mutación sin sentido. "La duplicación homocigotos que involucra los exones 11 y 12 es un hallazgo novedoso," señaló el Dr. Wong. Clínicamente, este paciente con la duplicación E11 a E12 tenía caf & # 233; au lait spots y fue diagnosticado con cáncer de útero en el cáncer de colon y los 27 años a los 43 años.

Según el Dr. Wong, "Esta estrategia combinada nos proporciona una nueva herramienta para el análisis molecular fiable de cualquier genes que contienen múltiples copias de secuencias altamente homólogas y debe mejorar la tasa de hallazgo positivo para los pacientes con síndrome de Lynch si el gen PMS2 se sospecha que es defectuoso. La identificación inequívoca del exón 14 supresión en pacientes con síndrome de Lynch sospechoso refleja la principal ventaja de este enfoque, ya que los métodos moleculares tradicionales no pueden distinguir la deleción del gen activo de la del pseudogene debido a frecuentes conversión génica entre estas secuencias altamente homólogas ".

En enero de 2009, la Evaluación de Aplicaciones Genómicas en la práctica y Prevención Grupo de Trabajo (EGAPP) emitió recomendaciones en relación con las estrategias de ensayos genéticos en pacientes recién diagnosticados con cáncer colorrectal. A pesar de que sólo el 2% y el 4% de los cánceres colorrectales se debe al síndrome de Lynch, la identificación de estos individuos es visto como una manera crítica para mejorar su propia salud, así como la salud de sus parientes de sangre, que tienen una alta probabilidad de haber heredado el condición. Los individuos con síndrome de Lynch tienen un riesgo del 16% de desarrollar un segundo cáncer colorrectal primario dentro de 10 años, y los familiares de primer o segundo grado con la cara síndrome de Lynch un riesgo 35% a 45% de un nuevo cáncer a los 70 años. Una vez diagnosticado el síndrome de Lynch, las personas que no han desarrollado el cáncer se les ofrecería colonoscopias regulares y otros ensayos de vigilancia contra el cáncer colorrectal, endometrio u otros tipos de cáncer.

Según el Instituto Nacional del Cáncer, el cáncer colorrectal es el cuarto cáncer más común en los EE.UU., y se espera que resulte en 49.700 muertes en los EE.UU. en 2015, con 132.700 nuevos casos diagnosticados en ese año. Es más común en hombres que en mujeres y se diagnostica con mayor frecuencia en individuos de 65 a 74 años.